从前有个放鹅娃尼尔斯，因为他捉弄小精灵，所以小精灵一怒之下，把尼尔斯也变成了拇指大的小人儿。他去向动物询问小精灵的去向，但因为之前欺负动物，所以没有人帮他，混乱中，他骑上一只鹅，与雁群一起去旅行。
一天晚上，尼尔斯从狐狸斯密尔口中救下了大雁阿卡，紧接着又救下了松鼠和自己的鹅。后来，他又帮助了黑老鼠，又口哨弄走了灰老鼠，取得了白鹳的信任，去参加了“鹤之舞大会”。
在大会上，斯密尔又来袭击了，后来，他又和水獭、紫貂联手进攻——但都被尼尔斯阻止了。
在他们去高山的路上，遇见了大雾。在紧急之时，雄鹅莫顿不见了。有一天，尼尔斯在厄兰岛饲养场发现了鹅，并请求让鹅不要再走散了。
但是，第二天，鹅又走失了。尼尔斯在乱石堆里发现了一只小灰雁，他这发现：这是一只脱臼的灰雁，雄鹅莫顿一直在照顾他。助人为乐的尼尔斯治好了小灰雁，一起飞回了雁群。
他们继续飞着。突然，海上起了暴风雨，雁群坠入海中，此时，海豹也来了袭击了。他们只能被迫躲进一个山洞。尼尔斯他们遇见了羊群，一齐赶走了三只狐狸。
但是，尼尔斯决定要永远除掉狐狸。他与雄鹅一起勾引着狐狸，终于，把它们弄进万丈深渊，使山羊们又过上了正常的生活。
白鹳把尼尔斯带.0279.nEt走，想让他救个城市，失败了。
后来，尼尔斯被抓住了，他被乌鸦威协着去打开一个罐子，尼尔斯不愿意，便杀了为首的乌鸦，然后骑着鹅飞走了。当晚，他们住在牛棚，他发现母牛的女主人去世了，尼尔斯安葬好女主人，到塔山与雁群会合了。尼尔斯再一次发现，狐狸斯密尔又赶了上来，它非常想抓住尼尔斯。
“湖水在一天天上涨，天鹅的窝与蛋正岌岌可危。”斯密尔骗信鸽，让他传话给阿卡。
阿卡知道了消息，便泅水去拜访，但天鹅们却对雄鹅冷嘲热讽，大雁们只好趁乱飞走。
之后的一天，尼尔斯饿了，他突然发现一只狐狸在抓一只天鹅。因为尼尔斯救了狐狸，所以尼尔斯被狐狸追赶着。最后，他与看门狗一起抓住了斯密尔。
渡鸦巴塔基蛊惑尼尔斯出来冒险，但是第一次失败了，但是在渡鸦的激将法里，男孩儿便同意了。
他开始与一个大学生聊天，他放弃了渡鸦给他变人的机会。渡鸦只好飞走了。
尼尔斯把小灰雁送回了她母亲旁边。他们还看见一只雄鹰在捕杀一只海鸥，他一提到阿卡，那鹰肃然起敬，然后飞走了。
此时，意外又发生了，一只灰雁叼住尼尔斯，逃走了。“啪！”又是一声枪响，尼尔斯落了下来。
经过这一次次历险，尼尔斯成了一个好男孩，深知了友谊，重新变成了人。
