第一篇:gene ontology(GO基因解释)
GO(gene ontology)是基因本体联合会(Gene Onotology Consortium)所建立的数据库,旨在建立一个适用于各种物种的,堆积因和蛋白质功能进行限定和描述的,并能随着研究不断深入而更新的语言词汇标 准.GO是多种生物本体语言中的一种,提供了三层结构的系统定义方式,用于描述基因产物的功能.
基因本体论(gene ontology)的建立
现今的生物学家们浪费了太多的时间和精力在搜寻生物信息上。这种情况归结为生物学上定义混乱的原因:不光是精确的计算机难以搜寻到这些 随时间和人为多重因素而随机改变的定义,即使是完全由人手动处理也无法完成。举个例子来说,如果需要找到一个用于制抗生素的药物靶点,你可能想找到所有的 和细菌蛋白质合成相关的基因产物,特别是那些和人中蛋白质合成组分显著不同的。但如果一个数据库描述这些基因产物为“翻译类”,而另一个描述其为“蛋白质 合成类”,那么这无疑对于计算机来说是难以区分这两个在字面上相差甚远却在功能上相一致的定义。
Gene Ontology(GO)项目正是为了能够使对各种数据库中基因产物功能描述相一致的努力结果。这个项目最初是由1988年对三个模式生物数据库的整合开始:: FlyBase(果蝇数据库Drosophila),t Saccharomyces Genome Database(酵母基因组数据库SGD)and the Mouse Genome Database(小鼠基因组数据库MGD)。从那开始,GO不断发展扩大,现在已包含数十个动物、植物、微生物的数据库。
GO的定义法则已经在多个合作的数据库中使用,这使在这些数据库中的查询具有极高的一致性。这种定义语言具有多重结构,因此在各种程度上都能进行查询。举 例来说,GO可以被用来在小鼠基因组中查询和信号转导相关的基因产物,也可以进一步找到各种生物地受体酪氨酸激酶。这种结构允许在各种水平添加对此基因产 物特性的认识。
GO发展了具有三级结构的标准语言(ontologies),如表所示。根据基因产物的相关分子功能,生物学途径,细胞学组件而给予定义,无物种相关性。
本体论内容分子功能本体论基因 产物个体的功能,如与碳水化合物结合或ATP水解酶活性等生物学途径本体论分子功能的有序组合,达成更广的生物功能,如有丝分裂或嘌呤代谢等细胞组件本体 论亚细胞结构、位置和大分子复合物,如核仁、端粒和识别起始的复合物等
基本来说,GO工作可分为三个不同的部分:第一,给予和维持定义;第二,将位于不同数据库中的本体论语言、基因和基因产物进行联系,形成网络;第三,发展 相关工具,使本体论的标准语言的产生和维持更为便捷。
本体论(The ontologies)
GO的结构包括三个方面?D?D分子生物学上的功能、生物学途径和在细胞中的组件作用。当然,它们可能在每一个方面都有多种性质。如细胞色素C,在分子功 能上体现为电子传递活性,在生物学途径中与氧化磷酸化和细胞凋亡有关,在细胞中存在于线粒体质中和线粒体内膜上。下面,将进一步的分别说明GO的具体定义 情况。
基因产物
基因产物和其生物功能常常被我们混淆。例如,“乙醇脱氢酶”既可以指放在Eppendorf管里的基因产物,也表明了它的功能。但是这之间其实是存在差别 的?D?D一个基因产物可以拥有多种分子功能,多种基因产物也可以行使同一种分子功能。比如还是“乙醇脱氢酶”,其实多种基因产物都具有这种功能,而并不 是所有的这些酶都是由乙醇脱氢酶基因编码的。一个基因产物可以同时具有“乙醇脱氢酶”和“乙醛歧化酶”两种功能,甚至更多。所以,在GO中,很重要的一点 在于,当使用“乙醇脱氢酶活性”这种术语时,所指的是功能,并不是基因产物。
许多基因产物会形成复合物后执行功能。这些“基因复合物”有些非常简单(如血红蛋白由血红蛋白基因产物α-球蛋白、β-球蛋白和小分子的亚血红素组成),有些非常复杂(如核糖体)。现在,小分子的描述还没有包括在GO中。在未来,这个问题可望由和现在的Klotho和LIGAND等小分子数据库联合而解 决。
分子功能
分子功能描述在分子生物学上的活性,如催化活性或结合活性。GO分子功能定义功能而不是整体分子,而且不特异性地指出这些功能具体的时空信息。分子功能大 部分指的是单个基因产物的功能,还有一小部分是此基因产物形成的复合物的功能。定义功能的义项包括催化活性、转运活性、结合活性等,更为狭窄的定义包括腺 苷酸环化酶活性或钟形受体结合活性等。
生物学途径 生物学途径是由分子功能有序地组成的,具有多个步骤的一个过程。举例来说,较为 宽泛的是细胞生长和维持、信号传导。一些更为具体的例子包括嘧啶代谢或α-配糖基的运输等。一个生物学途径并不是完全和一条生物学通路相等。因此,GO并 不涉及到通路中复杂的机制和所依赖的因素。
细胞组件
细胞中的位置指基因产物位于何种细胞器或基因产物组中(如糙面内质网,核或核糖体,蛋白酶体等)。GO的形式
GO 定义的术语有着直接非循环式(directed acyclic graphs(DAGs)的特点,而并非是传统的等级制(hierarchy)定义方式(随着代数增加,下一级比上一级更为具体)。举个例子来说,生物学途径中有一个 定义是己糖合成,它的上一级为己糖代谢和单糖合成。当某个基因被注解为“己糖合成活性”后,它自动地获得了己糖代谢和单糖合成地注解。因为在GO中,每个 术语必须遵循“真途径“法则,即如果下一代的术语可以用于描述此基因产物,其上一代术语也可以适用。
GO的解释(Annotation)
那么,GO中的术语如何和相对应的基因产物相联系的呢?这是由参与合作的数据库来完成的,它们使用GO的定义方法,对它们所包含的基因产物进行注解,并且 提供支持这种注解的参考和证据。每个基因或基因产物都会有一个列表,列出与之相关的GO术语。每个数据库都会给出这些基因产物和GO术语的联系数据库,并 且也可以在GO的ftp站点上和WEB方式查询到。
并且,GO联合会提供了简化的本体论术语(GO slim),这样,可以在更高级的层面上研究基因组的功能。比如,粗略地估计哪一部分的基因组与信号传导、代谢合成或复制有关。
GO对基因和蛋白的解释阐明了基因产物和用于定义他们的GO术语之间的关系。基因产物指一个基因编码的RNA或蛋白产物。因为一个基因可能编码多个具有很 不相同性质的产物,所以GO推荐的解释是针对基因产物的而不是基因的。一个基因是和所有适用于它的术语联系在一起的。
一个基因产物可以被一种本体论定义的多种分支或多种水平解释。解释需要反映在正常情况下此基因产物的功能,生物途径,定位等,而并不包括其在突变或病理状 态下的情况。GO联合会的各个数据库成员采用手动或自动的方式生成解释,这两种方式共有的原理是:一.所有的解释都需要有来源,可以是文字、另一个数据库 或是计算机分析结果;二.解释必须提供支持这种基因产物和GO术语之间联系的证据。
GO文件格式
GO的所有数据都是免费获得的。GO数据有三种格式:flat(每日更新)、XML(每月更新)和MySQL(每月更新)。这些数据格式都可以在GO ftp的站点上下载。XML 和 MySQL 文件是被储存于独立的GO数据库中。如果需要找到与某一个GO术语相关的基因或基因产物,可以找到一个相应表格,搜寻到这种注解的编号,并且可以链接到与之对应的位于不同数据库的基因相关文 件。
GO浏览器和修改器(browser and editor)
GO术语和解释使用了多种不同的工具软件,它们都可以在web方式的“GO 浏览器”下“GO software page”中找到。大多数GO浏览器都是web模式的,允许你直观的看到术语和其相关信息,如定义、同义词和数据库参考等。有些GO浏览器如AmiGO和 QuickGO,可以看到每个术语的解释。而可下载的DAG-Edit编辑器,一样可以离线地显示解释和所有本体论定义的信息。对于每一个浏览器来说,都 可以选择最适用于你要求的工具软件。
常见的三种浏览器
AmiGO from BDGP在 AmiGO中,可以通过查询一个GO术语而得到所有具有这个解释的基因产物,或查询一 个基因产物而得到它所有的解释关系。还可以浏览本体论,得到术语之间的关系和术语对应的基因产物数目。AmiGO直接连接GO下的MySQL。MGI GO BrowserMGI GO的功能类似于AmiGO,所不同的在于它所得到的基因为小鼠基因。MGI GO浏览器直接连接GO下的MGI数据库。QuickGO at EBIQuickGO,整合在EBI下的InterPro中,可以通过查询一个GO术语而得到 它的定义与关系描述、在SWISS-PROT中的定位、在酶分类学(EC)和转运分类学(TC)中的定位和InterPro中的定位等。
其他还有一些特殊的浏览GO的浏览器,其中括号中为建立机构和主要特色: EP GO Browser(EBI,基因表达情况),、GoFish(Harvard,Boolean查询、GenNav(NLM, 图像化展示)、GeneOntology@RZPD(RZPD,UniGene)、ProToGO(Hebrew University,GO的亚图像化)、CGAP GO Browser(癌症基因组解剖工程,癌症)、GOBrowser(Illuminae,perl.、TAIR Keyword Browser(TAIR,拟南芥)、PANDORA(Hebrew University,非一致化蛋白)。
修改器
GO 术语和本体论结构可以由任何可以读入GO平板文件的文本修改器进行编辑,但是这需要对平板文件非常熟悉。因此,DAG-Edit是被推荐使用的,它是为 GO特别设计的,能够保证文件的句法正确。GO解释可以被多种数据库特异性的工具所编辑,如TIGR的Manatee和EBI的Talisman tool。但是GO数据库中写入新的解释是需要通过GO认证的管理员方可进行的,如果想提出新的解释或对本体论的建议,可以联系GO。
主要修改器为DAG-Edit和COBrA。DAG-Edit基于Java语言,提供了能浏览、查询、编辑具 有DAG数据格式的GO数据界面。在SourceForge可以免费下载,伴随着帮助文件。COBrA能够编辑和定位GO和OBO本体论。它一次显示两个本体论,因此可以在不同的水平相应定位。(如组织和细胞类型水平)优点在于可以综合几种本体论,支持的文件格式多,包括GO平板文件、GO RDF和OWL格式等。
如图为DAG-Edit的界面,可以分为四个部分:
1)定义编辑面板(term editor panel)
显示当下的本体论。也是主要的编辑本体论结构的工具,可以通过点击和拖动术语来修改本体论的从属关系。
2)文本编辑面板(text editor panel)
修改术语中的内容。在修改多个术语时,会出现一个选择菜单,可以选中后逐个修改。
3)DAG浏览器
DAG浏览器是一个插件,能够以图形的方式展示具有复杂的从属关系的术语。4)搜寻/屏蔽面板 可搜寻术语、术语类型和术语间关系。可自定义屏蔽条件,限制得出的搜寻结果。
GO数据库的查找和浏览FAQ
1.如何搜寻解释?
使用AmiGO浏览器,可以在所有参与的数据库中搜寻一个特定的注解。AmiGO允许使用GO术语或基因产物的搜寻。搜寻结果包括GO对这个术语的等级分 级情况,定义和近义结构,外部链接,所有相联系的基因产物和它的下一级术语。2.如何得到全部的GO解释?
在GO网站上,基因产物与GO联系的组信息都有提供。这些文件储存了基因/基因产物的ID和引用文献等支持证据(如FlyBase 基因ID, SWISS-PROT蛋白ID),在ftp站点上都可以获得。
3. 在一些模式生物中,一个基因通常有多个与之相关的核苷酸序列,如EST、蛋白序列等。要查询到这些序列,可以从该模式生物数据库中通过基因联系(gene association)查询到基因获得ID(gene accession ID),或是分别在Compugen中查询大的转录产物(transcipt)和SWISS-PROT/TrEMBL中查询蛋白。4.如何得到由GO术语注解的蛋白序列?
在GO网页上选择能查询到所有数据库的Amigo浏览器,键入GO术语(如“线粒体”),在结果中显示了被解释的基因。然后选择你所需基因,在网页的最低 端把选项拖至“get fasta sequence”区域,再确定即可。
5. 如何能够找到所有和一个特定的GO术语相关的人类基因呢?
GO术语是和SWISS-PROT/TrEMBL/InterPro and Ensembl中的蛋白序列无赘余地对应的。这些解释在EBI上的GOA-Human 文件中,GO的FTP站点上,Ensembl,EMBL-Bank上都可找到。
6.可以直接使用GenBank的gi获取码在GO数据库中进行查询吗? GO数据库中除了Compugen所提供的GenBank获取码之外,没有包含其他GenBank获取码的信息,但是在EBI的GOA(GO Annotation)中,有一个综合的对GenBank/EMBL/DDBJ进行查询的方式,详细请见:ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/GO/goa/HUMAN/xrefs.goa.GO与其他分类系统的定位关系(Mapping to GO)
GO 并不只是希望为基因组建立一个标准化的、结构清晰的解释语言。GO致力于各种基因组数据库的标准化。GO为各种基因组分类系统和GO解释之间的转化提供了 转化表,见http://
数据库索引文件来源UniProt Knowledgebasespkw2goEvelyn Camon(Note: spkw2go used to be called swp2go, all files remain the same.)Enzyme Commissionec2go Michael Ashburner EGADegad2goMichael Ashburner GenProtECgenprotec2goHeather Butler and Michael AshburnerTIGR role tigr2go Michael Ashburner TIGR Families tigrfams2go TIGR Staff InterProinterpro2goNicola MulderMIPS Funcatmips2goMichael Ashburner and Midori HarrisMetaCyc Pathwaysmetacyc2go Michael Ashburner and Midori HarrisMultiFun Classificationsmultifun2goMichael Ashburner, Jane Lomax and Margrethe Hauge SerresPfam Domainspfam2goNicola MulderProdom Domains prodom2goNicola MulderPrints Domainsprints2goNicola MulderProSite Domainsprosite2goNicola MulderSmart Domainssmart2go Nicola MulderREADME
需要注意的是,这些转化不是完全而精确的。其中的一个原因可能是GO有一套完整的定义系统,而很多数据库并不具有。
GO的应用
GO的局限性
1.GO 不是基因序列或基因产物数据库,相反的,GO强调基因产物在细胞中的功能。
2.GO不是整合数据库的一种方式(如联邦式整合数据库),它并不能做到这点是因为:
a.更新速度较慢
b.由于每个人对数据定义的方式不同,标准难以达到一致。
c.GO并不对生物学的每个方面进行描述。如功能域的结构、3D结构、进化等。3.GO 是对基因功能的注解,但是有其局限性。比如说,GO不能反映此基因的表达情况,即是否在特定细胞中、特定组织中、特定发育阶段或与某种疾病相关。GO虽然 不涉及这些方面,但是支持其他的OBO(open biology ontologies)成员成立其他类型的本体论数据库(如发育本体学、蛋白组本体学、基因芯片本体学等)
用于基因组分析
基因组和全长cDNA序列工程通常会根据序列的相似性,推测基因与已解释的基因功能类似。现在最常用的手段是在SWISS-PROT序列中设定一个相似性 的域值,使用计算机化的方法来判断。因此,根据这一原理,也可以得到新的GO解释(被标记为“根据电子解释推测”)。一个GO的重要应用方面是对于一个 GO术语,能形成一个相联系的基因产物组。举例来说,某一基因产物可以被精确地解释为在碳水化合物代谢的一个特定的功能,如葡萄糖代谢,而在总结碳水化合 物代谢时,所有这些基因产物都会聚集到一起。GO计划为每一个高频出现的术语建立文档总汇,现在有些已经在“GO Slim”中实现了。
用于基因表达分析
如在芯片数据中引入GO解释,通常可以揭示出为什么一个特定组的基因拥有相似的表达模式。共表达的基因可能编码在同一个生物过程中出现的基因产物,或定位 于同一个细胞部位的。如果未知基因和一些已被GO过程术语相似地解释了的基因共表达,那么这个未知基因很有可能在同一个过程中发挥功能。分析和操作基因表 达芯片数据,并且又能结合GO解释的软件已产生。EBI 提供的Expression Profiler,和EP:GO都具有此功能。
GO可能的应用
GO的应用前景很广阔,不可能一一列出,现在已用到的包括: 1. 整合来自于不同生物的蛋白组信息。2. 判定蛋白结构域的功能。
3. 找到在疾病/衰老中异常表达的基因的功能类似性。4. 预测与一种疾病相关的基因 5. 分析在发育中同时表达的基因
6. 建立起自动的能从文献中获取基因功能信息的工具。
GO规模
如上所述,GO的三层结构是分子功能、生化途径和细胞组件。GO包含的大部分为平板格式文件(GO flat file),由每一种本体论中定义的文件为文本文件,而包含本体论和定义两种格式的是OBO格式的平板文件,XML作为可以用于三种本体论和所有定义的文 件格式也有提供。这些文件都在每月的1日更新,GO每月将给出月份更新报告。
GO的使用和引用
GO 的使用
基因本体论联合会是由国家人类基因组研究所(NHGRI)的R1拨款所赞助,此外还有欧盟RTD项目“生活质量和生活资源管理”拨款。Gene OntologyTM 由AstraZeneca公司提供资金赞助,而SGD小组得到了IncyteGenomics的赞助。
GO数据库中的术语、解释等都属于公共范畴。GO的资源是免费的,但是必须在以下三种情况下使用:
1.必需引用基因本体论联合会。
2.所使用的GO文件必需标明GO的版本号和日期。(GO处于不断更新中)3.GO文件的内容和内在的逻辑关系不得被更改。
引用GO
当使用GO资源时,请引用以下文献:
Gene Ontology: tool for the unification of biology.The Gene Ontology Consortium(2000)Nature Genet.25: 25-29.当引用亚数据库资源时,请参考GO的 publication list
第二篇:解释格式
一、中文专著、学位论文、学术报告
序号、.文献题名.版本.出版地:出版者,出版年:起止页码。例如:
1、刘少奇.论共产党员的修养.修订2版.北京:人民出版社,1962:50。
2、张三.物权立法的本土资源研究.<博士论文>.北京:中国人民大学,2022:27-28。
二、中文期刊文章
序号、.文献题名.刊名,年,卷(期):起止页码。
例如:
3、李国海.论反垄断法制裁手段及其范围.中南大学学报(社会科学版),2022(2):193-198。
三、中文专著及论文集中的析出文献
序号、析出文献主要责任者.析出文献题名.载:原文献主要责任者.原文献题名.版本.出版地:出版者,出版年:析出文献起止页码
例如:
4、张光斗.也谈21世纪高等工程教育的改革.见:林功实.立足国内培养跨世纪研究生.北京:北京理工大学出版社,1996:105~110。
四、电子文献
序号、主要责任者.电子文献题名.电子文献的出处或可获得地址,发表或更新日期/引用日期(任选)。
5、王明亮.关于中国学术期刊标准化数据库系统工程的进展.http://,1998-10-04
五、外文文献
所引用语种通常解释体例。例如:
6、Scholkopf B, Smola,A.Learning with Kernels.Cambridge: MIT Press, 2022
解释格式如下:
引自期刊: ① : 《题名》,《刊名》,××××年第 ×期,第 × 页
引自专著: ② : 《书名》,出版者及×××× 年版,第 × 页
引自报纸: ③ : 《题名》,《报纸名》年-月-日(版次)参考文献著录格式如下:
引自期刊:[ 1] (所有全列—下同).题名[ J].刊名 , 出刊年 ,卷(期): 起止页码.引自专著:[2] .书名[ M].版次(初版不写).译者(指译著, 所有译者全列).出版地 : 出版者 , 出版年.页码.引自报纸:[3] .题名[ N].报纸名 , 年-月-日(版次).引自论文集:[4] .题名[ A].见 : 论文集编者.文集名[ C].出版地 : 出版者 , 出版年
第三篇:红色基因文档
发扬红色精神,传承红色基因
“北国风光,千里冰封,万里雪飘”。这是毛主席对祖国由心的赞誉,亦是对中华民族深深的忠爱,当然,这亦是我们每个中华儿女深深的共鸣。生于这个和平美好的时代,我们是否会因为生活的安逸而忘记对祖国所肩负的重任?我们是否会因为风沙的覆盖而忘记祖辈们所留下的光荣印记?我们是否会因为时间的洗礼而放弃那该我们铭记于心的红色内涵?相信我们的回答都会是否定的。作为中华民族的一员,我们都在祖国的呵护和抚爱中长大,对祖国所经历的历史又怎能轻易的就从记忆中抹去。
回想祖辈们的艰难抗战路,眼框便不自觉的被打湿,耳中满是中华战士们那充满力量的咆哮和怒喊之声,心中也好似有一团烈火在激愤中燃烧。“喜看稻菽千重浪,遍地英雄下夕烟”。汗洒疆土只为民之安乐,伤痕若揭只为国之复起,枪声,炮声,泪血声,忘不掉的抗战岁月,挥不去的复国神话。他们,只为了国,他们,亦为了民。今天,我们之所以能够收获丰厚的稻菽,全是因为抗战英雄们在前线疲于奔命,不惧死亡,用自己的血汗将偷盗者阻挡在了围栏之外。二万五千里漫漫长征路,他们是风雨中那屹立不倒的擎天柱,支撑着祖国的山河,不显一丝颓势。食过皮带,啃过树皮,饮过泥水,只为躲避敌人,积蓄更多力量。这是对革命理想和事业无比忠诚,坚定的信念,亦是不惧死亡,敢于胜利的无产阶级乐观主义精神,更是一种团结互助,不折不挠,勇往直前的中华民族精神,这就是永不过时,我们永远都需学习和发扬的红色精神。
“红色基因”作为中国共产党人最主要的精神内核,是中华民族的精神纽带,孕育了永不言弃的抗震救灾精神,北京奥运精神,载人航天精神„„,鼓舞着一代又一代中华儿女为了中华民族的伟大复兴而勇往直前。作为中华儿女的我们,也须不负肩之使命,传承和发扬好红色精神,为了祖国更加美好灿烂的明天而努力奋斗。
还记否?那场令所有炎黄子孙都为之心痛的五一二汶川大地震,它夺去了多少汶川同胞的生命和健康,震塌了多少那被人称作“家”的房屋。但再大的苦难也抵挡不住中华民族这面屹立不倒的高墙和中华儿女前仆后继的爱国爱民之情。它让我们看到了“众志成城”的动人场面,它亦让我们感受到了那种团结一心,不折不挠的抗震救灾精神。
还记否?那场令无数中华儿女都为之骄傲和自豪的北京奥运会,激起了多少颗为之动容的心,扬起了多少个为之奋斗的魂。它让我们看到了中华的崛起和国力的日渐强大,它亦让我们感受到了那种坚持不懈,运动不止的北京奥运精神。
还记否?那场令所有华夏子孙都为之疯狂和激动的太空旅行,它实现了多少仁人志士的航天梦想,完成了多少祖辈一生的追求和渴望。它让我们看到了“坚持就是胜利”的不败箴言,它亦让我们感受到了那种自强不息,顽强拼搏的载人航天精神。忘得掉的是岁月,忘不了的是历史。盖得住的是皱纹,藏不住的是印迹。我们都处在岁月的长河中,记忆难免有时候会被奔腾的河流和飞卷的沙石所冲淡和埋藏,但我们的心却注定是与祖国相连,将所有有关祖国的历史和精神都封存在我们的心里。在未来的道路上,我也会继续将红色精神和红色基因发好好的发扬起来,做一名有担当,有抱负,有梦想的华夏人。
传承红色其因,携手共筑民族复兴中国梦
同学们好,老师好,我叫,是来至六年级的学生。今天我演讲的题目是《传承红色其因,携手共筑民族复兴中国梦》。
历史的启迪永在,精神的价值长存。习爷爷曾多次强调,历史是最好的教科书,中国革命史是最好的营养剂。而党的红色基因产生于井冈山、古田、遵义、延安以及西柏坡艰苦卓绝的革命斗争中。先前在新疆军区视察时习近平就曾叮嘱部队领导,要把红色基因融入官兵血脉,让红色基因代代相传。在江西调研中习近平首次提到“多接受红色基因教育”,有助于以红色基因形成强大的向心力和感召力,为全面建成小康社会垒筑起坚强的精神基石。
红色基因是我们的根,是我们事业的灵魂,是我们取得革命胜利以及社会主义现代化建设一切成果的根本保障。传承红色基因,让我们的旗帜永不褪色,我们才能跑好实现中国梦的精神接力。习近平观看开国元勋、牺牲烈士照片墙和烈士英名录,既表明红色基因代代相传、革命事业后继有人,同时也明确说明今天的幸福生活来之不易,必须倍加珍惜。我们必须坚持从小事做起,善始善终、善作善成,把红色基因代代传下去,让革命事业薪火相传、血脉永续。
“行程万里,不忘初心”,崇高的理想信念要坚持下去。理想的动摇是最危险的动摇,没有理想信念,理想信念不坚定,精神上就会“缺钙”,就会得“软骨病”。习爷爷插队时每次到延安,“都要来看看,每次都受到精神上的洗礼”。对于新时期共产党人来说,就必须在思想上拧紧螺丝、防微杜渐,自觉做理想信念的传播者。
“我们是人民的勤务员,帮你们跑事的。”习爷爷一席话让群众暖洋洋。做好人民的勤务员,才能获得人民的拥戴。从梁家河到中南海,几十载春秋,习近平行了万里路,也在行走中倾力做好各地人民的好公仆。革命时期,井冈山人民为红军送去了豆腐和南瓜,是对党和红军的拥护;现今,百姓为***送上鸡蛋和橘子,更是对党和习总书记的拥戴。看齐总书记,领导干部就必须任劳任怨地坚守自己的岗位,想群众之所想、急群众之所急,把权力用在解决群众困难问题“刀刃”上,以党员干部的“辛苦度”赢得广大群众的“获得感”。“空谈误国,实干兴邦”。无论做红色基因的接班人,做理想信念的传播者,还是做人民的勤务员,都必须落到行动中来。领导干部必须把精力用在深入实际、联系群众、解决问题、干事创业、赶超跨越、推动发展的主战场上来,把红色基因和理想信念浸透到日常点滴中,切实使其内化于心、外化于行。
幸福不会从天而降,梦想不会自动成真。在实现中华民族伟大复兴中国梦的征程中,在经济新常态语境下,要做到“红色基因代代传,革命精神永不变”,就必须树立党的宗旨意识、构筑牢固的思想防线,坚持权为民所用、利为民所谋、情为民所系,以抓铁有痕、踏石留印的干劲,把“三严三实”作为转变工作作风的“风向标”、解决问题的“监测仪”,全心全意为人民办实事,在真抓实干中携手共筑民族复兴中国梦
传承红色其因,争当双好少年
同学们好,老师好,我叫,是来至六年级的学生。今天我演讲的题目是《传承红色其因,争当双好少年》。
我小时候喜欢听红军歌,喜欢看红军影视剧,喜欢游览红军故地。说到这儿,我会不禁自问,红色文化是什么样的文化?她有哪些动人的故事?她对于今天的我们,到底有什么现实价值和意义?
我带着这样的疑问走进书店,找到一本书,书名叫《红军过草地》,便有滋有味地看起来。红军为了完成任务,连野草都吃,一个手掌大的青稞饼,几个人推让来推让去,谁都舍不得吃,这是什么样的精神?他们团结一致,越过千山万水,宁可饿死,也不愿做敌人的俘虏,这是什么样的精神?看到最后,我泪如雨下,红色文化,令人感动。
什么是红色文化?虽然我还只是一个孩子,但我多少能感悟到一些:崇高的理想、坚韧的毅力、团结的力量、不怕困难、不畏牺牲、终生奋斗!
我们是少年,今天,我们踏着红色的足迹,传承着红军文化,努力争当祖国的双好少年:热爱祖国、理想远大,为了实现中华民族的伟大复兴,努力向前。祖国是耀眼的太阳,我们将是灿烂夺目的光环。祖国是我们的母亲,我们要好好学习报答祖国。我们有着自己的理想,向着理想而前进,为祖国增添一道亮丽的风景。
我们争当双好少年:勤奋学习、追求上进,丰富的知识是我们翱翔的翅膀,飞向蓝天。祖国是和谐的家园,每个人享受着幸福和温暖。“好好学习,天天向上;虚心好学,刻苦钻研”,是每个学生的座右铭。“团结友爱,互相帮助;帮助别人,快乐自己”,是每个少年时刻不忘的真理。为自己存在的价值而努力,就是上进。
我们争当双好少年:品德优良、团结友爱,挽起我们友谊的双手向着未来,勇敢登攀。祖国是广阔的舞台,我们将成为未来的中坚。鸟美在羽毛,人美在心灵。人的心灵美才是最美的。品德思想最重要,它是唤使你去做每一件事的方向盘。所以大家要心灵美,知道感恩。帮助别人,快乐自己。人与人要互相帮助,要互相团结,团结力量才会大。我们争当双好少年:体魄强健、活泼开朗,用充沛的精力把祖国建设的重任扛在双肩。
“海阔凭鱼跃,天高任鸟飞”,未来的路还很长,只有学会创新,学会开拓才会取得进步。我们用爱心、恒心、信心托起自己,一起去传承红色文化,争当双好少年吧!少年强,则国强,我坚信,祖国的明天会更加美好!
第四篇:基因药物
基因药物
摘要:随着现代生物技术的发展,特别是以基因工程为基础的人类基因组计划的展开,迅速的推动生物技术领域的发展。基因药物就是基因工程技术发展的产物,这样高技术含量的药物的出现既带来了巨大的效益,同时也存在着极大的风险,本文对基因药物的发展、作用、成就和风向等方面的问题进行综述。
关键词:基因工程 基因药物 选择性
基因工程是通过对核酸分子的插入、拼接和重组而实现遗传物质的重组,再借助病毒、细菌、质粒或其他载体,将目的基因转移到新的宿主细胞,并使目的基因在新的宿主细胞内复制和表达的技术。基因是DNA分子上的一个特定的片断,因此基因工程又称DNA分子水平上的生物工程。现代遗传学家认为,基因是DNA(脱氧核糖核酸)分子上具有遗传效应的特定核苷酸序列的总称,是具有遗传效应的DNA分子片段。基因位于染色体上,并在染色体上呈线性排列。基因不仅可以通过复制把遗传信息传递给下一代,还可以使遗传信息得到表达。不同人种之间头发、肤色、眼睛、鼻子等不同,是基因差异所致。基因药物的诞生
随着人类基因组逐渐被破译,一张生命之图将被绘就,人们的生活也将发生巨大变化。基因药物已经走进人们的生活,利用基因治疗更多的疾病不再是一个奢望。因为随着我们对人类本身的了解迈上新的台阶,很多疾病的病因将被揭开,药物就会设计得更好些,治疗方案就能“对因下药”,生活起居、饮食习惯有可能根据基因情况进行调整,人类的整体健康状况将会提高,二十一世纪的医学基础将由此奠定。
近20年来,DNA重组技术与基因治疗技术发展十分迅速,已进入实用化阶段。DNA重组技术的进展,大大增进了人们对生命本质的认识,包括对疾病遗传基础的了解。今后对癌症的发生机制,疾病的遗传特性,免疫系统的功能,代谢衰竭性疾病的病因和大脑功能的物化机理获得进一步的了解,从而诞生对遗传性疾病和重大疑难疾病治疗的新途径。基因药物就是基因工程技术发展的产物。它的出现将使现有的医疗实践发生革命性的改变,使一切疾病变得可为人们征服。人们渴望的远离疾病,而拥有健康体魄的时代正向我们走来。基因药物的发展
基因药物随着基因工程技术的发展而发展,大致经历了一下几个个阶段: 细菌基因工程:它是通过原核细胞(常用大肠杆菌)来表达目的基因的,这个工程相当复杂,成本和工艺上也有许多问题。细胞基因工程:细胞基因工程也有不足之处,因为人或哺乳动物细胞培养的条件相当苛刻,成本太高,这样就限制了细胞基因工程的发展。其三是转基因动物:即把人或哺乳动物的某种基因导入到哺乳动物的受精卵里,每个细胞里都带有导入的基因,而且能稳定地遗传到下一代。这样一种新的个体,称为转基因动物。转基因动物的问世,为利用新的基因工程手段获得低成本高活性的基因药物开辟了一条新的途径。其四是合成生物学:通过计算机辅助设计优化次生代谢反应链,人工合成基因调控网络,从而实现在工程菌或酵母细胞内表达外源药用生物分子的代谢工程,尤其是天然药物次生代谢药物分子。基因药物的选择性
基因药物具有很高的选择性。一种基因药物并不是适用于所有的人种,不同人种的基因存在较多差别。暂且不说白人、黑人、黄种人之间的基因差别,就连我国南方人和北方人都存在基因差异。例如镰刀形贫血病在黄种人中发现很少,但在白人和黑人中发病率很高,原因是白人和黑人体内有一种寄生虫,患镰刀形贫血症能使患者体内产生一种抗体,从而抵御寄生虫。因此,这种治疗镰刀形贫血症的基因药物只能给白人和黑人服用。另外,不同的生活环境也需要不同的基因药物。如人们最渴望用基因治疗的癌症,也有环境特性:肝癌。在亚洲发病率较高,肺癌、胃癌、食管癌、肝癌是中国人多发的顽症,而直肠癌则是美国发病率最高的癌症。因此,环境也是研制基因药物最重要的内容之一。如果我国制药业仍然以仿制为生,那么到时候,基因药物不但不能治病,反而要变成生命“杀手”了,后果将会不堪设想。目前,我国制药行业的首要任务是,如何提高自己的制药技术,争取生产出适合我国人们使用的基因药物。
基因药物与动物药厂
科学家发现,人类的很多先天性疾病是由于缺乏与之相应的基因造成的,而靠现在一般的药物很难治愈,如将正常人的正常基因片段导入到动物体内,让这种基因在哺乳动物体内表达,就可从该动物分泌的乳汁或者其他组织提取获得具有活性的基因药物,用于治疗该基因缺损造成的疾病。这种通过转基因动物获取药物的方法称为动物药厂。动物药厂改变了人们对药厂的印象。它看起来更像是一个牧场。在这里,成群的转基因牛羊在绿色的草地上吃草,表面看,它们与普通牛羊没有差异,然而,它们体内分泌的乳汁是能给人类治病的药品,这些产乳量高的动物,就相当于一座大型的药物工厂,以它们廉价的乳汁,为人类提供着大量的所需要的珍贵药物。基因药物的经济意义
据专家预测,下世纪疾病的基因治疗将大规模地从试验进入临床应用。届时,利用生物技术生产的药物将大量问世,生物制药业将成为21世纪发展最快的高科技产业之一。生物高技术医药工业虽具有强投资、长周期、高风险的特点,但一经产业化就会带来高额利润,与传统医药产业相比、动物药厂更具有投资少、效益高、无公害等优点。
医学遗传家曾益滔介绍,做细菌基因工程需要很大的车间发酵;做细胞工程药物也需要很多昂贵的设备来培养细胞,而若用转基因动物,就只要饲养,动物乳汁便可源源不断地产出药品。
现在研制一种新药,一般需要20年至30年,即使科技再发展,也很难低于10年至15年,转基因羊周期一般是18周,牛也只需2年至3年,而效益更是惊人。如荷兰金发马公司用转基因牛生产的一种乳铁蛋白,制成奶粉具有转铁、抗菌等功能,预计每年这一营养奶粉销售额是50亿美元。
1998年2月上海医学遗传研究所试验成功的转基因山羊所表达的“凝血因子”如进入工业生产也将具有惊人的产值。据美国资料统计,过去凝血因子Ⅶ都是从献血的血源中提取的,全美国这方面的病人一年需求约为120g左右,这120g得从120万升的血浆中提取,以每人献血200ml计,就需要600万个献血者提供血浆。若改用转基因牛来生产,只需1.2头牛产的牛乳即可满足。转基因动物带来的这场生物医药革命,不仅产生了巨大的经济效益,而且还使人们传统的医疗方式发生变化,人们可以一边喝着鲜美的牛奶,一边达到了治病的目的,这个质的变化不能不令人心动。基因药物所取得的成就
基因重组技术取得了一个个丰硕成果。1978年合成了人工胰岛素,1979年实现了生长激素基因在大肠杆菌中的表达,1982年研制成功了人工干扰素,基因制药从此走上了产业化道路。但是,目前的基因药物是通过基因重组技术培育大肠杆菌和动物细胞来制造的,而大肠杆菌这类低等生物是不可能生产出结构复杂的药物,动物细胞培养的成本又太高。所以,利用基因重组与移植技术来培育转基因动物生产药物便应运而生了在利用转基因动物提取药物方面,英国科学家首开先河。1997年年底,英国PPL治疗学公司率先利用克隆“多利”所采用的“细胞核转变”法,培育出200头携带人体基因的绵羊,并成功地从奶汁中提取了α-1抗胰蛋白酶。这是科学家首次从遗传工程培育的绵羊的奶中,提取可用于治疗人类疾病的药物成分,为建立“动物药厂” 打下了基础。随后,芬兰科学家将人体的促红细胞生长素基因,植入乳牛的受精卵中,创造了一种能生产出促红细胞生长素的乳牛。从理论上说,这种乳牛一年可提取60-80千克促红生长素,比目前全世界的使用量还多。基因药物带来的风险
基因组药物的运用,将在医学上产生革命性的变化。药物将针对具体的每一个人,治疗效率变得更高,并且更省钱。”科学家这样告诉我们理解DNA。但我们距离那一天还很遥远。如果我们人体生理学方面的知识没有取得决定性的进展,那DNA序列的测试将变得毫无意义。“我们必须了解,生病的时候,人体内部发生了怎样的变化,我们要怎样去干预、治疗以及预防。对于未来的药物,我们需要扎实的知识和信息来分析基因和各种疾病之间的关系,至少对于一些常见病需要能够弄清楚这些关系;此外,我们还需了解一些外在因素对疾病的影响。”
科学家认为,在未来,更多情况下障碍还是来自生物的多样性,即不同的人种带来的差异问题。大概在30年前,医生开始使用一种强力杀死细胞的药物来治疗患白血病的儿童。这种叫做6-巯基嘌呤(6MP)的药物拯救了成千上万的生命。然而,这种药物会产生一定的副作用。早在20多年前就已经研究发现,它的毒素能够滞留病人体内,并且会遗传。这种药物能够迅速积累,然后渗入骨髓,进而产生感染。不同的人种,这种酶缺陷的人所占比例是不一样的。例如,在高加索人中,每300个人中就有一个这样的人,这样的人是不能接受6MP治疗的,否则会带来致命的危险。这种困惑将是未来的基因组药物普遍遇到的问题,基因药物的风险是肯定的。基因兴奋剂由于基因药物的高效性,可以用它将人们改造得身强体健,所以有些为了创造成绩不顾一切的运动员和教练就开始铤而走险,打起了基因药物的主意。利用基因技术改造人体风险很大,所以体育协会将基因兴奋剂列入禁止名单,严格禁止使用。
人类基因组工作草图公布之后,许多人都认为基因治疗癌症的梦想就要实现了。但是科学家一致认为,尽管基因工程被利用到很多方面,并且取得了一定的成就,我们还没有跨入真正的基因时代。目前仅仅只是开始。换言之,想要达到基因治疗癌症的梦想还只是有了基础而已,同样的,我们现在还没到达利用基因信息直接生产响应药物的地步,所以基因药物也只是凸显冰山一角而已。
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第五篇:胰岛素基因
糖尿病是由于体内胰岛素相对或绝对不足造成的一种常见的内分泌代谢疾病。目前糖尿病已经成为继心脑血管和肿瘤之后第三位严重危害人类健康的疾病。随着人类社会的发展,营养性肥胖、缺乏运动、老龄化等问题越来越严重,这将大大提高糖尿病的发病率。仅我国糖尿病患者的人数就高达3000多万,且每年仍以20%的速度递增。而胰岛素是机体降低血糖的唯一的一种激素,也是临床上治疗人类I型糖尿病的首选药物,因此医用胰岛素的市场需求量也随之加大。而胰岛素的生产方法从最初直接从人和动物胰腺中提取,发展到利用不同生物类型的基因工程生产胰岛素。鸡蛋作为生物反应器因其生产周期短、成本低、蛋白质易于分离和纯化等独特的优势,成为今后生产药用蛋白的研究方向。本实验首先是从人类胎儿胰腺中提取胰腺细胞总RNA,并依据Genbank上公布的人类胰岛素基因序列,利用primer5.0生物学软件设计出一对特异性引物,采用RT-PCR法获得了350bp的人类胰岛素基因片段(INS),测序结果表明克隆的人类胰岛素基因序列和Genbank公布的一致。然后构建出pUC57-INS,用于人类胰岛素基因的保存和扩增。最后再将INS片段亚克隆到含有绿色荧光蛋白标记基因的真核表达载体pEGFP-N1上,后经PCR、酶切和测序等方法证明人类胰岛素基因真核表达载体pEGFP-N1-INS构建成功,用于制备转人类胰岛素基因鸡方面的研究。本试验采用了脂质体包埋和鸡胚显微注射的方法将构建好的pEGFP-N1-INS转染至鸡胚中来制备转基因鸡。先后收集河南卢氏绿壳蛋鸡种蛋220枚,设置未处理的20枚种蛋为空白对照组孵化后,发现种蛋受精率为85%。转基因操作后的200枚种蛋在孵化过程中共获得不同胚龄的死胚82只,雏鸡24只,操作后未发育的转基因种蛋94枚。先后对82只死胚进行融合蛋白(人类胰岛素与绿色荧光蛋白)的绿色荧光检测,发现4只死胚组织有绿色荧光出现,蛋白阳性率为4.88%。然后再利用primer5.0生物学软件设计的一对特异性引物,对荧光检测呈阳性的死胚组织进行PCR检测,有2只呈阳性,人类胰岛素基因检出率为2.44%。目前还3只活鸡,为保护试验材料,仅作血液目的蛋白检测,结果未发现蛋白阳性个体。本试验说明依次方法制备转人类胰岛素基因鸡是可行的。为利用转基因鸡高效生产药用胰岛素等对人类有益的生物制品奠定了基础